将同文馆改建为京师大学堂的折子，正是光绪授意都察院左都御史孙家鼐等人上的。
孙家鼐和翁同龢一样，都曾担任帝师，他们两人在此时的朝廷中枢中，是最有威望的两位大臣。不过在穿越而来的光绪心目中，孙家鼐比起翁同龢来，要更加务实和开明。历史上，正是这位孙家鼐在甲午的时候，强烈反对为朝鲜的宗主权和日本开战。戊戌时期，身为帝党的他赞成光绪的许多新政，并担任京师大学堂管学大臣一职。戊戌变法失败后，慈禧“罢新法，悉复旧制”，却独留京师大学堂，而身为帝党的孙家鼐也未获罪。仅此一点便可以看出，孙家鼐绝非庸碌之辈，也不是空有书生意气，不懂朝局政治的迂腐之人。
事实上，在光绪眼里，这位孙家鼐也并非最合适的人选，孙家鼐虽然也主张向西方学习，走的却仍然是后来张之洞提出的“中学为体，西学为用”的路子，这种缝缝补补的见识和光绪想要的差距甚远。
从深心里说，光绪也很希望像发现陈卓那样，发现一个主持京师大学堂最合适的人选，但是历史毕竟是历史，哪里又有那么多金手指可以开。在这个举国封闭，一片蒙昧的时代，能够有这样的见识已经很不错了，况且光绪终日都在皇宫里面和那些大臣打转，也没有时间和条件去慢慢发掘。
所以从去年年末，光绪便有意识的频繁和孙家鼐这样的御史清流们接触，畅谈国事，明晰学识，为的也正是开办京师大学堂。而这些人当中，最有可能支持光绪的，恐怕也只有孙家鼐了。
果然，在明白了光绪开办京师大学堂的主张后，孙家鼐大为赞同，并立即联络了几个御史清流，一同向朝廷上折建言，请求将同文馆改建为京师大学堂。
仁寿殿内，听着这个忽然冒出来的京师大学堂，慈禧也是颇为踌躇。
听了孙毓汶的解说，对这个京师大学堂慈禧也慢慢明白了所以，和当年赞同创办同文馆一样，对开办京师大学堂能够给眼下的朝廷带来的好处，慈禧内心中也是有几分认同的。
这些年来，这个朝廷都是她在当家，她自然明白朝廷的根底。朝廷中这些老臣勋旧虽有忠心，但却无办事能力，守成尚且不足，更加谈不上创新了。像李鸿章在北洋办的那些矿山、铁路、电报局、制造局等，哪一样不需要精通西洋诸学的人才，而这样的人才科举是万万培养不出来的，培养新的人才，只能改用新的办法。
但是孙毓汶最后颇有深意的一句话，又让慈禧大为头痛。孙毓汶告诉慈禧，开办京师大学堂是皇上的主意。
“皇上这些日子是怎么了，朝廷是事务也没见他这么用心过，怎么成天就琢磨开办学校的事情啊？”慈禧皱眉说道。
“微臣也不是很明白，所以特来请太后的示下。”孙毓汶不置可否的说道。
他对京师大学堂倒并不是很在意，秀才造反，十年不成。把一些个书生弄在一起，远远比不上那个新建陆军学校让人惊心的。他顾忌的是慈禧的态度，以及帝党一系，会不会因此逐渐得势。
见孙毓汶没有什么态度，慈禧又把目光投向了坐在一旁的刚毅。
见慈禧望向自己，刚毅迟疑了片刻说道，“奴才对开办京师大学堂有些异议，洋人的东西未必都是好的，不过是奇技淫巧罢了。纲常伦理，道德文章，向来是我朝取士的根本。倘若开办京师大学堂，这些学子将来又能从朝廷获得官职，我朝的科举又将置于何处？岂不是寒了天下士子的心。”
孙家鼐的折子慈禧并没有看，也不知道里面有着这么一条，从京师大学堂毕业的学子，朝廷将实授官职。此刻听刚毅一说，拿过桌上的折子仔细的看了一会儿说道，“我看孙家鼐的折子里说的也不是没有道理，倘若朝廷将来不给这些毕业的学子一定的官职，你们想想，又有谁会去读这个京师大学堂呢？科举连着官场，士子们才会趋之若鹜，这里面的道理你们都清楚，总还是要有点实在的利益，才会让士子们弃旧学而就新学嘛。”
“太后的意思奴才明白，但是科举是固国安邦的根本，国之重器不能轻动，还望太后深思。”刚毅垂首说道。
“科举还是要办的，这个京师大学堂嘛……”慈禧犹豫了一下说道，“回头我再把皇上叫来斟酌一下，但是你们几个军机大臣心里也要有个数，倘若咱们大清也能像洋人那样造出坚船利炮，又何至于现在处处看洋人的脸色呢？就算是奇技淫巧，学一点也影响不了什么大局。”
说着慈禧又深深的叹了口气，“要是这些法子是你们想出来的，你们说我心里该有多高兴啊。你们也要给我争争气，不要什么事情都落在皇上身边那些人的后面，忠心要有，做事情的能力也要有，你们啊，多向李鸿章学学吧，那才是真正的老诚谋国。”
孙毓汶和刚毅赶忙站起身来，恭谨的答应了一声，心中除了些许的不以为然外，更多的是一种莫名的疑虑和惊惧。
看情形，太后对开办京师大学堂还是支持的，一个陆军学校，现在又是一个京师大学堂，如今看皇上走的每一步，怎么都像是比照着太后的心思布下的路数，皇上这才二十岁，对太后的心意就琢磨的这么透彻，匪夷所思啊！
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